菌

菌 （きん） とは、元来、キノコを意味した。なお、漢字「菌」の訓は「きのこ」である。

近代には、菌類、つまり、キノコに似ていると考えられた生物の雑多なグループを指すようになった。この意味での「菌」は、学名の「‐mycota」「‐mycetes」など （ギリシア語で「キノコ」） の訳語であることが多い。

菌類には、互いに類縁関係の乏しい多くの系統が含まれる。その中で代表的なのは、キノコ・カビ・酵母などを含む真菌で、菌・菌類という言葉で真菌を指すこともある。たとえば、「菌界」は真菌の分類群である。

さらに、後になって発見された微小な生物であるBacteria（バクテリア）にも細菌（真正細菌）という単語が当てられた。一般に耳にする○○菌（結核菌や乳酸菌など）のほとんどは真正細菌に属する。

また、1990年になってBacteriaから切り離されたArchaea（アーキア）にも古細菌という単語が当てられている。日本語では慣習的にこちらも含めて細菌と呼ぶ場合と、真正細菌のみを細菌と言う二通りの場合があり、やや混乱している。

「菌」と呼ばれる生物

• 真核生物
  • オピストコンタ
    • 真菌
    • メソミセトゾア （偽粘菌・中動菌）
  • アメーボゾア
    • 動菌
      • 変形菌・粘菌
      • 原生粘菌（プロトステリウム類）
      • タマホコリカビ類 （細胞性粘菌参照）
    • アクラシス類 （細胞性粘菌参照）
  • ストラメノパイル
    • 卵菌
    • ラビリンチュラ類 （かつて変形菌門に分類された）
    • ネコブカビ類 （かつて変形菌門に分類された）
• 真正細菌
• 古細菌